Flashpaste хранит свои настройки и базы данных (по умолчанию), в папке %APPDATA%/Flashpaste/. Таким образом, для нормальной работы программы, она должна быть установлена в системе. В некоторых случаях бывает удобно запускать Flashpaste без предварительной инсталляции, просто скопировав рабочую папку программы, например на USB носитель.

В этом случае мы должны сообщить Flashpaste при старте, в каком месте у нас хранятся настройки и базы данных. Для этого можно использовать параметры командной строки. Flashpaste понимает следующий список параметров:

• -portable - Брать файл настроек flashpaste.cfg в текущей папке, кроме этого используем Common.db и Local.db из текущей папки.
• -a - Брать файл настроек flashpaste.cfg в текущей папке.
• -c=path_to_common_db - Использовать указанный файл в качестве общей базы данных, игнорируя настройки в cfg файле.
• -l=path_to_local_db - Использовать указанный файл в качестве локальной базы данных, игнорируя настройки в cfg файле.
• -createreg - Создать файл с регистрационной информацией fkey.bin в папке программмы.
• -usereg - Использовать файл с регистрационной информацией fkey.bin.

Например, если вы хотите, чтобы Flashpaste использовала файл настроек из текущей папки и базу данных, расположенную по адресу c:\OurDB.db, вы должны использовать следующую строку для запуска программы:
    Flashpaste -a -c=c:\OurDB.db

Для запуска программы без установки, например с USB диска, рекомендуются сделать следующее:

• Скопировать файл настроек flashpaste.cfg (если уже создан) из %APPDATA%/Flashpaste/ в папку с исполняемым файлом.
• Скопировать туда же общую и локальную базы данных. Файлы баз данных должны называться Common.db и Local.db соответственно. Если базы данных отсутствуют, они будут созданы в текущей папке.
• Создать файл с регистрационной информацией, запустив Flashpaste c ключем -createreg.
• Использовать _RUN_Flashpaste_Portable.bat для запуска программы.